實驗室凈化系統工程是企業針對一些要求相對較高，實驗樣品對環境相對敏感。或者是空氣質量過差會污染實驗樣品，如生物制品、微生物研究、腦細胞實驗室、干細胞實驗室、血細胞實驗室、動物實驗室、生物安全實驗室、病毒研究實驗室等場合，就會必須要求對實驗室或者實驗室某些區域進行空氣凈化工程系統處理。以使實驗室的基礎設施達到符合實驗要求的標準，實驗才得以安全進行。實驗環境要求相對較高的實驗室或者無菌室。實驗室凈化工程系統與傳統的潔凈室系統其實是大同小異的，只不過實驗室對潔凈室內的壓力、微生物控制及溫濕度控制相對較工業潔凈室要嚴格。

    實驗室凈化系統工程根據工藝要求和功能布置選擇一定數量的通風柜，有的還兼有部分局部排風罩。通常校核下來換氣次數遠遠大于10次，一般在20-30次以上，滿足換氣次數要求。一般采用組合式空調機組，其送風系統與各業潔凈室工程不同的地方是，不是所有實驗室都可以設置回風系統的，這需要根據用戶實驗室的用途以及實驗產品而定。類似于生物安全類實驗室就不可以做回風系統，或者說要以全排式潔凈室的做法來施工。一般的無菌室實驗室潔凈度等級都是萬級，一般普通實驗室則大范圍十萬級~萬級的布局設計。生物安全實驗室、陽性對照實驗室以及微生物培養實驗室則需按照靜態百級的潔凈室標準進行設計、施工。